MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 7255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015942	AGGGC	2	10	1704834	1704843	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4002	NC_015942	AGG	2	6	1704893	1704898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015942	AT	3	6	1708473	1708478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_015942	TTA	2	6	1708495	1708500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015942	GGA	2	6	1709918	1709923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_015942	GA	3	6	1709922	1709927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_015942	ATA	2	6	1710114	1710119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_015942	AC	3	6	1710196	1710201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_015942	TAA	2	6	1710259	1710264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015942	CGA	2	6	1710270	1710275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_015942	ATT	2	6	1710284	1710289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015942	TG	3	6	1710705	1710710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_015942	TGC	2	6	1710727	1710732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_015942	GCC	2	6	1710764	1710769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_015942	ACCTGG	2	12	1710866	1710877	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_015942	TGG	2	6	1710907	1710912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_015942	CTG	2	6	1710930	1710935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_015942	GAA	2	6	1711017	1711022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_015942	TTC	2	6	1711529	1711534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_015942	GAT	2	6	1711589	1711594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_015942	GCGA	2	8	1711695	1711702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_015942	AGC	2	6	1711705	1711710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_015942	ATGGT	2	10	1711859	1711868	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_015942	CAA	2	6	1711885	1711890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_015942	TTA	2	6	1711903	1711908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015942	AAG	2	6	1711911	1711916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015942	GAG	2	6	1711921	1711926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_015942	CAC	2	6	1712544	1712549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_015942	GGT	2	6	1712587	1712592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_015942	ATG	2	6	1714146	1714151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015942	CAT	2	6	1714196	1714201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_015942	ACCT	2	8	1714942	1714949	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_015942	ATT	2	6	1714966	1714971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_015942	TAT	2	6	1715722	1715727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_015942	ATG	2	6	1715733	1715738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_015942	CGA	2	6	1715749	1715754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_015942	T	6	6	1715987	1715992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015942	CTG	2	6	1716784	1716789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_015942	GCT	2	6	1716796	1716801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_015942	TTC	2	6	1716823	1716828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_015942	CTG	2	6	1716834	1716839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_015942	TGGT	2	8	1716874	1716881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015942	ATAA	2	8	1716905	1716912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_015942	AAT	3	9	1717029	1717037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_015942	GTT	2	6	1717547	1717552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_015942	TAG	2	6	1717565	1717570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_015942	T	6	6	1717601	1717606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_015942	ACGT	2	8	1717615	1717622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_015942	AAAC	2	8	1719289	1719296	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_015942	GGC	2	6	1720496	1720501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_015942	AGA	2	6	1721848	1721853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_015942	GCA	2	6	1721902	1721907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_015942	TGG	2	6	1721943	1721948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_015942	TG	4	8	1721949	1721956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_015942	GTAA	2	8	1721984	1721991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_015942	ACC	2	6	1722063	1722068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_015942	AGC	2	6	1722080	1722085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_015942	ACAGA	2	10	1722108	1722117	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4059	NC_015942	AGC	2	6	1723182	1723187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_015942	ATT	2	6	1723210	1723215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015942	CA	3	6	1723220	1723225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_015942	AATAAA	2	12	1723230	1723241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015942	ATG	2	6	1723256	1723261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015942	TCA	2	6	1723282	1723287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_015942	TAAC	2	8	1723289	1723296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_015942	T	8	8	1723340	1723347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015942	AAT	2	6	1723397	1723402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_015942	T	6	6	1724801	1724806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015942	GCT	2	6	1724860	1724865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_015942	AATG	2	8	1724904	1724911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_015942	GTC	2	6	1724924	1724929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_015942	TGC	2	6	1724965	1724970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_015942	CTA	2	6	1725035	1725040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_015942	CTCGT	2	10	1725118	1725127	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4075	NC_015942	CTC	2	6	1725181	1725186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_015942	AGC	2	6	1725249	1725254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_015942	AGCT	2	8	1725291	1725298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_015942	TAA	2	6	1725341	1725346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_015942	ATA	2	6	1725357	1725362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_015942	GCC	2	6	1725469	1725474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_015942	GTT	2	6	1725499	1725504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_015942	GCC	2	6	1725633	1725638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_015942	TG	3	6	1725640	1725645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_015942	CA	3	6	1725672	1725677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_015942	CAG	2	6	1725769	1725774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_015942	TTCC	2	8	1725796	1725803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_015942	CCA	2	6	1725816	1725821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_015942	CGG	2	6	1725825	1725830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_015942	TTA	2	6	1725860	1725865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015942	CCA	2	6	1725936	1725941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_015942	CTC	2	6	1725955	1725960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_015942	CCA	2	6	1725995	1726000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_015942	GCA	2	6	1726050	1726055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_015942	TCC	2	6	1726085	1726090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_015942	CCG	2	6	1726136	1726141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_015942	AGGG	2	8	1726271	1726278	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_015942	GGGTA	3	15	1726308	1726322	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_015942	G	7	7	1726323	1726329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015942	CTA	2	6	1726399	1726404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_015942	CAA	2	6	1726417	1726422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_015942	A	6	6	1726421	1726426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015942	TGG	2	6	1726463	1726468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015942	GCT	2	6	1726511	1726516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_015942	AAC	2	6	1726531	1726536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_015942	TAT	2	6	1726549	1726554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015942	AAG	2	6	1726568	1726573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_015942	GGT	2	6	1726587	1726592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_015942	CAC	2	6	1728184	1728189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_015942	AGA	2	6	1733555	1733560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_015942	CCT	2	6	1733561	1733566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_015942	AGGC	2	8	1733679	1733686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_015942	CCT	2	6	1734034	1734039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_015942	GCT	2	6	1734105	1734110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_015942	AGTA	2	8	1734116	1734123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015942	GAC	2	6	1734127	1734132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_015942	GAG	2	6	1734177	1734182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015942	GAC	2	6	1734184	1734189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_015942	GGCG	2	8	1734207	1734214	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_015942	TGC	2	6	1734238	1734243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_015942	CTG	2	6	1734254	1734259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_015942	CCTT	2	8	1734260	1734267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_015942	ATA	2	6	1734294	1734299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_015942	TAT	2	6	1734302	1734307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015942	ATG	2	6	1735592	1735597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015942	CAC	2	6	1735624	1735629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_015942	GC	3	6	1735666	1735671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_015942	TGC	2	6	1735675	1735680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_015942	C	6	6	1735700	1735705	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4129	NC_015942	G	6	6	1735712	1735717	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_015942	GGC	2	6	1735752	1735757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4230	NC_015942	TATCC	2	10	1821349	1821358	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4249	NC_015942	AC	3	6	1832525	1832530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4250	NC_015942	TC	3	6	1832575	1832580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4251	NC_015942	CCT	2	6	1832581	1832586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4252	NC_015942	CTCA	2	8	1832618	1832625	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4253	NC_015942	C	6	6	1832636	1832641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4254	NC_015942	ACC	2	6	1832693	1832698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4255	NC_015942	GCC	2	6	1832702	1832707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4256	NC_015942	CCAT	2	8	1832715	1832722	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4257	NC_015942	GCG	2	6	1832726	1832731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4258	NC_015942	A	7	7	1832734	1832740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_015942	TGA	2	6	1832772	1832777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_015942	AAT	2	6	1832848	1832853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_015942	CATT	2	8	1832867	1832874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4263	NC_015942	T	6	6	1832884	1832889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_015942	C	10	10	1832895	1832904	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4265	NC_015942	GC	3	6	1832936	1832941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4270	NC_015942	CT	3	6	1833184	1833189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4271	NC_015942	TGG	2	6	1833202	1833207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4274	NC_015942	CTG	2	6	1833232	1833237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4283	NC_015942	CAG	2	6	1833745	1833750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4284	NC_015942	CTG	2	6	1833752	1833757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4293	NC_015942	CCG	2	6	1834098	1834103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4335	NC_015942	CCT	2	6	1842829	1842834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4339	NC_015942	ATA	2	6	1843026	1843031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4346	NC_015942	AAC	2	6	1846448	1846453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4365	NC_015942	TCA	2	6	1850834	1850839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4376	NC_015942	CCT	2	6	1855279	1855284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4383	NC_015942	A	6	6	1857657	1857662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4384	NC_015942	CCTC	2	8	1857866	1857873	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4385	NC_015942	ATATG	2	10	1857896	1857905	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4386	NC_015942	AAC	2	6	1857946	1857951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4387	NC_015942	TA	3	6	1857956	1857961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4388	NC_015942	TGT	2	6	1857974	1857979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4389	NC_015942	TAA	2	6	1858011	1858016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4390	NC_015942	AGA	2	6	1858040	1858045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_015942	GTA	2	6	1858049	1858054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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